O Laboratório de Vale da Pedra tem as valências de Química Inorgânica, Química Orgânica, Microbiologia e Biologia. São realizados os ensaios dos parâmetros pelas seguintes técnicas analíticas:

• Métodos clássicos de microbiologia cultural: nº de colónias a 37º C e a 22º C, Bactérias coliformes, E. coli, Coliformes fecais, Enterococos, Clostridium perfringens, Pseudomonas aeruginosa, Anaeróbios sulfito redutores, Estafilococos coagulase positiva, Estafilococos coagulase negativa e Estafilococos totais
• Identificação e quantificação de Fitoplâncton e determinação de Biovolume fitoplanctónico em microscópio de inversão
• Determinação de Cheiro e Sabor em amostras de água por diluições sucessivas
• Determinação de Cor, de Cloro livre, de Clorofila a e feopigmentos, Alumínio, Nitritos, Fosfatos, Azoto amoniacal e Sílica por espetrometria de absorção molecular
• Determinação de Sódio, Potássio, Cálcio, Magnésio, Fluoretos, Cloretos, Nitratos, Sulfatos, Brometos, Cloratos e Cloritos por cromatografia iónica
• Determinação de THM e outros haletos de alquilo por cromatografia gasosa
• Realização de diversas determinações por técnicas analíticas de química clássica, como volumetrias ácido-base, oxidação-redução, complexometria, métodos gravimétricos, entre outros